系原生动物门的第一亚门，与第二亚门―纤毛亚门相对应。司运动的细胞器是伪足或鞭毛，胞核通常为1个，2个以上的情况为同形多核（纤毛类为二形多核，即大核和小核）。有性生殖是通过配子的完全接合进行的。生活史极为复杂。
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