又称沼气发酵.甲烷产生菌在严格厌氧的条件下，利用CO、CO2、乙酸或甲醇等物质产生甲烷的过程·甲烷产生菌主要是一类包括甲烷杆菌属（Methanobacterium），甲烷球菌属（Methanococus）和甲烷八叠球菌属（Methanosarcina）的细菌·此类微生物都是专性厌氧微生物，它们可以利用氢的厌氧氧化获取能量，以CO2为电子受体，终产物为甲烷和水，一些种类也可由乙酸、甲醇或CO的厌氧代谢产生甲烷·主要存在于无氧淤泥（如池塘、沼泽中）或瘤胃中·甲烷发酵并非甲烷产生菌的单一作用，是和其他微生物一起协同发酵的结果·