托克逊县隶属于新疆维吾尔自治区吐鲁番市，位于新疆维吾尔自治区中东部，天山南麓，吐鲁番盆地西部，地理坐标为：东经87°14′05″-89°11′08″，北纬41°21′14″-43°18′11″，东与吐鲁番市高昌区为邻，南与巴州尉犁县相接，西与巴州的和硕、和静县相连，北与乌鲁木齐市毗邻。县城托克逊镇距乌鲁木齐市公路里程162千米。托克逊县幅员面积16171.47平方公里，共有人口13.8万人（2013年）。托克逊县主要景区有盘吉尔怪石林、克尔碱岩画、克尔碱旅游区、万佛宫等。2020年7月29日，入选2017-2019周期国家卫生乡镇（县城）命名名单。